嫌疑人留在玻璃杯上的指纹。另外，踩在地上一堆衣服上的一枚鞋印也提供了较为价值的线索。
那枚鞋印的花纹呈六角菱形状，在周边的服装贸易市场上从未见过。无论是民警还是报案者，他们走进房间的时候都会小心翼翼地绕过散落在地上的那堆衣服，所以那枚鞋印只可能是凶手慌不择路时留下的。
根据旅馆其他客人的描述，警方大致掌握了两名犯罪嫌疑人的体貌特征：其中一个人年龄在40岁左右，身高1米65上下，体型微胖，长着一张大圆脸；另外一个人年纪较轻，身高大概有1米8左右，皮肤黝黑，眼睛细长，戴着鸭舌帽。两人说话都有安徽一带的口音。
遗憾的是，在信息技术尚不普及的九十年代中期，监控是个稀缺品。吉祥旅馆没有严格执行住宿登记制度，即使没有身份证，老板也会给客人办理入住手续。所以对于这两名“消失的客人”，警方无法得到更进一步的信息。
半个月后，大规模的排查工作开始了。专案组兵分两路，一路人去皖南地区比对指纹，另一路人则去调查那枚特殊鞋印的来源。
案件发生的1995年，电子指纹识别系统还没有使用，指纹比对全都是靠肉眼识别。一个地方的指纹库通常就是一摞白底