与现役的常规潜艇或核潜艇相比，磁动力超导潜艇具有结构简单、推力大、航速高、无噪声、无污染、造价低等显著优点。
超导磁流体潜艇的推进系统和电池舱位于艇身两侧，且充分利用舱室空间，布局灵活。动力系统大幅瘦身，意味着火力系统可以扩容，可以搭载更多威力强大的鱼雷和潜艇导弹，使潜艇的水下攻击力更强。
最重要的一点是，超导磁流体推进器用吸入导流管和喷出导流管替代螺旋桨。在强大的电磁作用下，海水高速进入吸入导流管，经加速后由喷出导流管射出，推动潜艇前进。
没有螺旋桨拍打水流，轴承、齿轮系统的减化减少摩擦，这些都使潜艇航行时的噪音降至极低，几乎实现“零噪音”。由于磁流体推进技术取代了传统的螺旋浆推动，超导潜艇的噪声显著降低，普通的反潜声纳对它束手无策，这将大大提高潜艇的隐蔽性和生存能力。
这种潜艇可以潜得更深，且极为灵活，可在水下“跳舞”。其艇身外壳由新型高强度材料制成，抗压力是普通潜艇的3倍。
一艘超导磁流体潜艇将配备6个以上的磁流体推进器，它们相互之间是独立的，任意改变其中某几个推进器的电流方向和强度，即可改变潜艇的航行