由长老会、护卫堂、执法堂、风信堂、战斗堂、保障堂构成，长老会是最高管理机构，负责整个第三军机处的管理，下面的每一个堂口分为七级，一般为七级执事至三级执事，上去就到二级执事和一击执事，也就是副堂主和堂主了。
如果按照武将等级来划分，那么从七级执事到一级执事分别对应校尉、膘骑将军、车骑将军、上将军、大将军、都督、太尉，等级是非常高的。
也就是说张宏强和张磊的军级已经是校尉级别了。
长老会成员和总管不设级别，他们一般都另有身份，即使没有，他们的级别也近乎等同于宰相了。
除了核心成员之外，第三军机处没有特别硬性的规定要求成员必须专职承担，更多的成员是以兼职的身份完成他们的任务，这样做的好处是能够将第三军机的触角延伸到社会的各个角落，便于开展各种隐秘的工作。
对于新加入的成员，第三军机处一般不安排任务，尤其是年轻成员，只有一个要求，那就是好好修炼、提升自身，同时也会考核各成员对于工作的悟性和适应能力，以便筛选重点培养对象。
只要成为第三军机处一员，就可以得到遍布南元大陆的机构的帮助，如果达到五级执事，就可以调配资