对改流后原土司贵族采取合理的善后措施，使土司贵族势力日微，有的以徒有虚名，很难再兴波澜，保证了中央政策实施的连续性和有效性。
也正是清雍正时期大规模改土归流的成功实施促成了中国古代封建王朝的最后一次盛世—“康乾盛世”。
而且一方面，瓦解了封建领主经济基础，一定程度上打破封建农奴的人身束缚，解放了劳动力，使相对先进的封建地主制生产关系得以建立。
原土司辖区，土民不能随意脱离居住地，土司私设关卡，对不交税入境的，大多采取极端手段。
日常生活中，土官把持一方，税率自定，巧设税收名目，对土民肆意征税剥削。
实行改土归流后，当地少数民族只向国家交纳赋税，取消其它苛捐杂税，税务负担大为减轻，对新开辟的地区，清政府多实行低税或免税，这些措施对恢复当地经济生产及树立新政形象具有积极的促进作用。
另一方面，改土归流后，极大地促进了内地与少数民族地区经济交往。
内地先进的纺织、冶炼等先进技术广泛传播开来，土民开垦荒山、种植粮食作物，使少数民族经济结构进一步优化，推动了社会经济的大发展。
改流后，