领族人帮助人类共同迎敌，格兰特傀儡人也拼死抵抗，加上伊特拉姆战士的不懈努力，总算将溃败的局面挽回。水中王国阿特兰蒂斯王国虽然已经脱离格兰特的统治，但最为同盟，也义无反顾的派兵增援，双方进入僵持阶段。
由于王室成员和科学家联盟生怕高科技泄露，当即封闭所有边境要道，也不向其他大国求援，所以当时没人知道是否能够赢得内战的胜利。
当这些生物兵器的创造者们将要被自己的作品毁灭的时候，另一个完美的合成生命体——艾尔菲丝站在了创造者身边。同样拥有精神控制能力的她将咒怨魔王的相当一部分生物兵器军团加以控制，让他们临阵倒戈。格兰特军队顺势全面出击，形成两面夹击态势，使得胜利的天平顷刻间倒向格兰特王国。
经过长达一年的征战，格兰特人终于赢得内战的胜利，但他们同样遭受了史无前例的损失。格兰特人始终无法消灭强大无比的咒怨魔王，因此艾尔菲丝倾尽全部力量，和最早的合成生命体玛雅生命体联手，将咒怨魔王封印在玛雅生命体体内。玛雅生命体就此失去意识，只能担任控制王国能源动力的机械。艾尔菲丝则由于几乎用尽了能量，陷入无尽的沉睡中。
生物兵器损失高达四分之三，大批精锐