明军德胜门、彰仪门两门的主力京师营团军、御林军都奉调入城，防务交给了各地勤王之师，那些卫所军大多于前期败战之后回城紧急整补，战力极差，士气更显低迷，令朝廷上上下下都十分担心，但在目前这样的局势下，天知道这些外省军队有否贰心，因此谁也不敢建议放他们入城。
御林军进城之后还是负责彰仪门方向，但又带来一个新的问题——因其是皇上的亲卫部队，与锦衣卫一样例行由贵戚勋显出任指挥使，如今担任此职的是皇上的堂姐夫、孝宗弘治皇帝的驸马都尉刘淳，即便他只是应个虚衔，但御林军各级官佐品秩要较其他军队高出一两级，如御林军副指挥使高礼便是正三品武职，统领毛福寿等人是正四品，都比京师营团军两位主将俞大猷、戚继光为高，因此朱厚熜于叛乱之夜许下的由俞大猷出任新设的九门提督一职就显得很不合适，于是内阁学士李春芳和兵部尚书曾铣建议，九门提督由高礼兼任，俞大猷副之。朱厚熜尽管心中不喜，可为了安抚御林军，免得再生出什么事端，也只得准其所奏，德胜门、彰仪门两门监领则分别由俞大猷和在初战中立下大功的御林军统领毛福寿兼任，责令他们督率所部加强城防守备，在城上准备了大量的火器与擂石滚木，一旦城外大军溃败，就要防