发行了一千万两的国库券，手里有了银子，朱厚熜的底气硬了许多，便责令内阁并六部有司，详细磋商并着速办理当前最为急迫的五大要务：
一是犒赏在北京保卫战中浴血奋战、守土卫国的全军将士，优抚伤员，为阵亡将士举行国葬并恩恤遗属，有功之人叙功论赏；
二是增兵守卫大同、真定（今河北正定）、保定、涿州（今河北涿县）、易州（今河北易县）等地，加派军士民夫整修山西至北京沿途城池关隘，派大将重兵驻守，严防鞑靼军队得知江南叛乱的消息之后趁火打劫，再度南下入侵；
三是责令各地官吏组织山西、河北并直隶诸府难民返乡，发给赈济口粮和越冬衣被，以借贷或租赁的形式为他们提供明年春耕所必需的种粮和农具，帮助他们恢复生产，并给房屋遭到损毁的百姓加发修缮费用；
四是妥善安置并赈济自江南逃难的百姓，务必不使一人冻饿而死。
五是加紧征募士卒，编练军队，做好平叛的各项准备。
说到征募士卒，此前兵部已从山西、河北逃难至京师的难民之中招募了十万新兵，使京城各军总兵力达到了三十多万。却因各边镇有军报呈递朝廷，声称鞑靼诸部虽已退兵出关，但仍聚集塞上，