朱厚熜又按照原定计划，投入到紧张繁忙的工作之中：
正月初二至初五，带领王公勋显、内阁学士、五军都督府及六部九司诸位大臣，逐一视察京城各军，观看操演，犒赏六军，激励全军将士戮力同心，匡扶社稷，剿平逆贼，光复南都。并颁下口谕，着内阁会同五府、六部有司尽快拟订优抚军户及义勇投军的民户之策，更公开承诺，待平定江南叛乱之后，给予对于家园被叛军侵占或袭扰的山东备倭军及河南卫所军等卫所军卒一定补偿。
正月初六，召见自江南逃回的文武官员，赐宴以示慰问，勉励已就任新职的官员谨遵王命，恪守臣职；命吏部有司尽快为尚未得缺的官员委任新职，广开报国之门，以伸报国之志；并于筵席之上，命人取来具保文书一火焚之，示意此事既往不咎。众人深感皇恩浩荡，痛哭阙下，几不自胜，皆戟指向天立誓愿为马前卒，引领王师克服江南。
正月初七，巡视刚刚恢复生产的怀柔铁厂，亲切慰问春节期间仍坚守在工作岗位上的工匠民夫，勉励大家广泛开展劳动竞赛和技术革新活动，以“多快好省”为原则加紧生产，不断改进生产工艺，不断提高劳动生产率。并要求怀柔铁厂在加强军工生产，保证军品供应的同时，分出一两个车间从事民品生产