照朱厚熜的本意，时务科初试经义只是个意思，应试生员文通理顺即可，不必过于拘泥文采风流，关键还是加考的具体时务科。可是，此事说起来容易，具体操作起来却是很难，一个很简单却又很棘手的问题是考题都不好出。朱厚熜苦思苦想了好几天，也实在想不出一个好办法，不得不祭出了另一个时空的曾令自己当年深恶痛绝的高考制度，命有司衙门精通时务的官员将每一科只拣最基础的知识出了考题，生员基础考试合格，便能参加殿试，由殿试决定取中与否。还特下恩旨，准许士子以白话答卷，或纵论自己所精通的农医百工之术，或就某一专门问题进行探幽发微，穷其至理。殿试试卷由有司衙门精通时务的官员阅卷，算学、格致、经济三科试卷还要呈送御览，由皇上亲自裁夺——朱厚熜有理工科学士学位，就自认为至少在这三科上面，要比明朝那些所谓“精通时务”的官员更高明一点。
朱厚熜如此亲历亲为，把自己累得半死，可惜效果并不遂人所愿——明朝士子一向不太重视实学，尤其是算学、格致和经济等致用之术，报名应试之人本就不多，能入朱厚熜法眼的人更是寥寥无几，甚至报考格致科的生员大都畅谈了自己炼丹的心得，有的还焉有其事地呈上了“长生不老药”的配方和“化铅