哈密卫:元为哈密力,于永乐二年内附,永乐四年置哈密卫于哈密城;成化九年,哈密被土鲁番占据,迁居苦峪;成化十八年夺回;弘治元年复为土鲁番占据,弘治二年夺回;弘治六年又为土鲁番占据,迁居大土剌;弘治八年之后相继内迁肃州境;嘉靖八年,朝廷正式放弃哈密,哈密卫也随之被废。
安定卫:元为撒里部畏兀儿,于洪武七年内附,次年置安定卫;洪武十年废,洪武二十年复设;永乐四年移居昔儿丁;正德年间,安定为蒙古占据,正德七年,朝廷废设安定卫。
阿端卫:元属撒里部畏兀儿,洪武七年分设阿端部;次年置阿端卫,十年废,永乐四年复置阿端卫,宣德七年徙治贴儿谷;正统年间废。
曲先卫:元为曲先答林元帅府,洪武初年内附,置曲先卫于阿真;洪武十年废,并入安定卫;永乐四年()复置曲先卫于药王淮;正德七年,药王淮为蒙古占据,朝廷废设曲先卫。
赤斤蒙古卫:元属沙州路,永乐二年内附,置赤斤蒙古千户所于赤斤站,永乐八年升置赤斤蒙古卫;正德年间部众内徙肃州南山;正德八年朝廷废设赤斤蒙古卫。
沙州卫:元为沙州路治所,永乐二年内附,次年置沙州卫;宣德九年迁居苦峪;正统十一