大明军事奇才戚继光组建起了东海舰队，纵横四海，剿灭盘踞在沿海诸岛上的倭寇；并不惜人财物力，组建起了遍布日本的情报网，为的就是有朝一日出兵日本，洗雪后世百年国耻！
日本同样被明太祖朱元璋钦定的《皇明祖训》列为“三十不征国”之一，欲要兴师远征日本，势必会招致朝野内外那些迂阔守旧的朝臣士子们的非议和诘难。好在根据被俘的倭寇招供，在他们之中，不仅仅有在国内战争中失败、沦为海盗的武士、浪人，还有不少人是日本九州各国大名的家臣和寺院的僧众。那些战国大名和寺院垂涎于中国的富庶，暗中支持勾结海盗商人，甚至派人假扮海盗骚扰和劫掠大明东南海疆和沿海州县。这一不经意的发现，立刻被朱厚熜有意地加以渲染和放大，成为说服朝野内外支持朝廷出兵惩戒倭国，使其官民诚心归顺天朝，不敢再生桀骜之志，袭扰大明万里海疆的一大理由。
根据圣谕和朝议决策，总参谋部于嘉靖二十八年就拟定了御倭作战方略，即以海陆大军兵出朝鲜合浦港，先攻占对马、壹歧两岛，再进击日本九州，灭掉指使手下入寇大明的萨摩、肥前、肥后等国大名；遣使问罪于日本天皇和室町幕府将军，责其遵从天朝号令，严加约束国内诸位大名领主不得冒犯大明天威、