高拱和爱将戚继光，朱厚熜没有召御前办公厅的当值秘书来记录，而是自己提起御笔，先给李时珍写了一份手札，表扬他忠勤王事、救死扶伤的职业精神，让他继续督导远征军做好卫生防疫工作。至于军中出现的那种怪病，倒可不必过于担心，一来多食瓜果菜蔬，二来三餐杂以粗粮，便能不药而愈。
接着，他又给高拱、戚继光写了一份手札，严厉斥责他们不遵从自己曾经说过的“军中一应医事，应悉数听从李先生的安排调度，任何人不得干涉”的上谕，瞒报军中重大疫情。日后但有类似情事，必须即刻奏报，违者严惩不贷。并着令他们会商南洋宣慰使司衙门，指示吕宋国提供大量瓜果菜蔬，务必在休整期间治愈军中病患——跨海远征不同于当初东海舰队在近海剿倭，若是从国内转运新鲜瓜果菜蔬，不但劳时费力，且路途遥远，等运到吕宋，少说也有一大半都腐烂了，还不如就在当地采办，照价给值，所需开销从吕宋国岁贡五十万两白银中扣减便是。同时，自己将责令军需供应总署给远征军调去一部分粗粮，此举并非朝廷拿不出那么多的白米细面，更不是有人故意克扣军粮，而是为着军中将士们的健康着想，他们要认真做好解释工作。
有御前办公厅的众多秘书朝夕侍奉左右、伺候文墨