朝欲要讨伐日本，最近的路线是由朝鲜的釜山、蔚山等港口出发，进占对马、壹歧两岛，从博多湾登陆北九州的藩国长门，当年元朝两度远征日本，选择的正是这条进军路线。加之北九州的藩国长门境内多山，地瘠人贫，并无实力强大的大名割据，利于明军登陆作战；先前受命驻节朝鲜，整训朝鲜军队的大明宣慰钦使赵隐，以及接替赵隐的俞大猷，也都倾向于选择这条进军路线。但是，总参谋部经过反复的推演，否决了他们上呈的作战方略。
总参谋部的理由主要有三条：
其一，元朝第一次出兵远征日本，即日本所称的“文永之役”后，时任镰仓幕府执政的北条时宗为了加强本州岛的国防，命藤原经资（注）负责督修了一道石垒，作为抵抗元军入侵的防御工事。这道石垒西起今津，东到箱崎，沿自然地形蜿蜒而行，长达多里，高约米，底部厚约米，面向大海的一侧垂直陡峭，面向大陆的一侧砌成斜坡，设若倭人据此坚守，无疑会给明军抢滩登陆造成很大的困难。
其二，博多湾风高浪大，又无合适的港湾可供船只驻泊避风。当年元军两度全军覆没于台风，便是前车之鉴。也就是说，明军先锋即便能以强大的火力为掩护，抢滩登陆成功，在兵员运送和后勤补给方面也会受