无法停泊一支庞大的舰队。为了稳妥起见，朝鲜水军必须另外停泊在一个更加安全的港口，以避开六月至八月日本海那变幻莫测、威力巨大的台风，免遭当年元朝大军两度殁于台风的悲惨命运。
其二，这些年里，明军大力修造战船，海军发展很快；同时，由于朝廷废弛海禁、大力开办海市，民间航运业也得到了飞速发展。但是，终因时间尚短，加之明军海军主力至今仍在南洋作战，大部分民间商船也被征集用于给南洋的大明远征军转运军需粮秣，因而此次中朝联军远征日本，运送军需粮秣的重任就落到了朝鲜水军的头上——此前汪直曾主动请缨，由他在日本就近收购粮食，从堺港运抵萨摩。但总参谋部考虑，一来日本产粮有限，就算是敞开在市面上收购，也未必能保证数万大军的供应；二来汪直突然在日本大举收购粮食，一定会引起倭人的怀疑，进而危及整个镇抚司日本情报网的安全，还是把运送粮食的重任交给了朝鲜水军。这一次联军进兵萨摩，为要确保以泰山压顶之势一举击溃岛津氏，第一军主力全部出征，由于运力有限，随船只能运来一个月的军粮，再加上这一年来汪直船队利用驻泊萨摩的机会屯集下来的粮食，勉强够两万人三月之需。朝鲜水军及时返回釜山休整，就能在日本海台风季节过去