乱后，幕府权威急剧衰败，动辄有藩国大名、地方领主率军上洛，威逼幕府将军，天皇就更不被人放在眼里，连日常生计都成了大问题。现今的天文天皇就靠鬻字卖画为生，还不得不把自己的两个女儿送到寺院出家，以节省皇室的开销。
生计困顿倒在其次，眼下局势越发混乱，尤其是纪伊三好氏家主三好长庆率军上洛，悍然放逐幕府将军，让天文天皇不禁有兔死狐悲之感。此外，日本战国时代，除了武士在大名之家领有一份俸禄之外，各战国大名、领主并不养兵，手下的足轻都是临时征召的领民，也就根本没有置办军需的传统，走到哪里抢到哪里，还美其名曰“就食于民”。这一次三好长庆率军进驻京都，就纵容手下兵丁大肆抢劫，虽说还没有人敢闯入禁宫，对天皇下手，京都里的公卿大臣却大多遭到了乱兵的洗劫。天文天皇自然就担心有朝一日，这样的悲惨遭遇降临到自己的头上。因此，对他来说，能否再掌权枢倒无所谓，只要平平安安、衣食无忧，就是他人生最大的福气，当然也就不会拒绝那位被山科卿带进宫的明国钦使的建议，几乎是欣欣然地带着皇后、太子、太子妃等人，和明国钦使离开了那座早已破败不堪的深宫大内。
跟已经做了几百年傀儡的天皇有所不同，幕府将军足