至巫妖两族大战后，人间仍有大巫部落，因为人类是女娲所造，他们视人族、妖族为一族，如今经过千年的休养生息，重新崛起，与人族大战不断。
但轩辕氏乃天定人皇，身后自然有天庭三教相助，轩辕氏拜阐教广成子为师，背靠大树，并不惧大巫部落。
人巫两族几经交战都不分胜负，九黎族部落蚩尤举部落之力，以巫族秘术造十二都天神煞大阵，欲聚十二巫祖之灵为几用，但广成子为轩辕氏师父，当然要出手助轩辕氏对抗蚩尤。
交战期间，昊天天帝又命九天玄女下界赠送天书，轩辕黄帝屡屡得胜，巫祖众人苦不堪言。
造成巫族这一切的原因都是因为昊天命九天玄女送来天书所致，巫族大巫刑天一怒之下欲伐天庭，逆天而行，被昊天天帝一剑斩下头颅。
不料刑天怨念太深，冲天的暴虐之气差点重伤昊天天帝，所幸昊天跑得快，这才逃过一劫。
至此，九黎族被灭，蚩尤战败，轩辕氏遂为人皇，得证果位。
三皇已经聚齐，还余下五帝。
轩辕氏功德圆满，归仙位时把帝位传给他的孙子颛顼。
颛顼的出生也是充满了奇异，母亲女枢有一次做梦，梦见一条直