各土司的联合抵制。
对流官的派遣，必须派去有能力、肯吃苦、清正廉明者。
荒芜无主的土地，招农民耕种；未开垦的土地，号召农民开垦，官府发给农具、种子、对新垦的土地。减免整治地区的赋税，没收铲除土司的土地，分发给百姓，让少数民族享受到整改后的切身利益。
大力兴修水利，将耕种、纺织、冶铁、烧窑、采矿等生产技术，在整改地区传播，使这些刀耕火种的穷山僻谷得到开发。提高百姓的生活水平。
开设学堂，设教师，让儿童免费入学。百姓明事理、动法纪，不为土司煽动，则治理起来事半功倍。
派探子深入村寨绘制地图、了解情况，派兵据守险要峪口，修筑碉楼工事，威慑土司，不与交兵。
修建道路，招揽少数民族劳动力。积极在各府县创办工厂作坊，首先招少数民族进场打工。
姚启圣看完这些办法后，陈赞道：“大将军，此方案刚柔并济，深得治大国之道。大善！只是为何修建道路，招揽少数民族劳动力。积极在各府县创办工厂作坊，首先招少数民族进场打工。下官愚昧，还请大将军告之！”
郑成功解释道，“现在西南少数民族的村落大多还处于蒙昧，