南明在大力推进改革的同时，吃了败仗的清军，也开始全面改进自己军队的建设。
早期的满清，还没有那种所谓“天朝上国”的优越感，甚至对汉人的军事实力，一直处于学习模仿态度。
此次南下之战，清军骑兵几乎没什么作为，尤其是在渡过长江之后，更是难以发挥骑兵的优势。
所以为了对付南明，清军决定加大火器的研发与装配。
通过缴获的手榴弹，清军很快研制出了一种简化版，利用明火引燃的球型手榴弹，实际上就是轻型“万人敌”。
清军的炮兵部队，也不在只装备单一的红夷大炮，而是增添了不少弗朗机后装炮，作为今后炮战中，杀伤敌军步兵的主要火炮。
同时清军也开始组建神机营，燧发枪成为神机营的远程输出装备，配合中程的弓箭手，其火力输出密度，并不比明军全火器部队差多少。
加上火器部队成军极快，新兵训练两三个月，就能上战场杀敌，这让清军看到了快速暴兵的办法，全力打造之下，短短半年时间，清军再次恢复了百万大军的实力。
而水师方面，自从郑芝龙交出兵权后，大明水师重新回到朝廷手中，长江水道再次被南明夺回，清军知晓破