也进行了一番大的调整，英亲王阿济格被调回北京，讨伐蒙古苏尼特部腾机思、腾机特等人叛乱。而豫亲王多铎出任南京留守司，协助洪承畴，平定南方。
虽然这一次多尔衮授于洪承畴极大的权力，就连多铎也只能出任洪承畴的副手，但他却并不但心会洪承畴会像吴三桂、尚可喜、耿仲明三人一样，在南方拥兵自立，因为多尔衮十分清楚，洪承畴降清的时间并不长，和尚可喜、耿仲明相比，在清廷缺乏根基，而和吴三桂相比，他手里又没有一支忠于自已付嫡系部队，而且这次在南方还有多铎在侧，虽然是协助洪承畴，但也无不监视之意，因此也不用怕洪承畴会趁机建立自己的私人力量，对他可以完全放心任用。
十天之后，洪承畴正式任职，从北京出发，在临行前，多尔衮和大清名议上的皇帝顺治亲自设宴饯行，并赐宝马、宝刀。以示对洪承畴的厚望。