留，决定率军北上迎战清军, 并伺机逃入陕西去, 仍然用用流冠战术, 与清军周旋。同时还尽杀自己入川之后所纳的妻妾，幼子，然后分兵四路，分由孙可望、刘文秀、艾能奇、冯双礼为大军的护卫,向陕西进发。于当年十月，张献忠亲率大军，扎营于西充凤凰山，与清军对持。
大西军的士兵本来都是四川农民，一多半都是被迫入伍，以前大西军连胜明军，到还没什么，但这时见清军势大，自己不可敌，都心无斗志，因此纷纷逃亡。而张献忠闻报之后，欲将所有逃兵全部诛杀，部将刘进忠进谏道：“生灵不可妄杀。” 但张献忠不纳，反调刘进忠回军凤凰山一同诛杀逃兵，但刘进忠害怕张献忠这时借故调自己返回，不敢自投虎口，于是连夜弃走，到清军的大营，向吴三桂投降。