吴军掷弹手开准机会，也不断把掷弹筒炮弹轰进清军人群密集处，炸得清军士兵上窜下跳，冲锋攻势更加凌乱不堪，软弱无力。
终于，吴军刺猬阵推进到了清军指挥部的两百米处，停下脚步掩护掷弹队轰击清军指挥部，不过很可惜，聪明过人的徐继畬早就料到吴军士兵是想来送他回家，早早就带着部将亲兵逃离了指挥台，吴军的密集火力覆盖收效并不大，没能炸死多少清军士兵。
不过也足够了，连绵不断的爆炸声中，不但清军的指挥号令旗接连倒地，徐继畬的帅旗也在轰击中飘飘落地，徐继畬再也无法通过旗号指挥整个茅津渡战场，清军的军心士气也遭到了重创。
这时，刘坤一也带着后军起了进攻，轻而易举的和前军联手杀溃了隔在两军之间的清军机动队，与前军汇为一股，然后立即向清军的渡口防御阵地起进攻。
守卫渡口的清军士兵开始欲哭无泪了，他们躲藏的坚固地堡全都是面向渡口码头，只能躲在工事后对着渡口码头开枪，背后却毫无防御，从背后杀来的吴军士兵想怎么对他们开枪就怎么对他们开枪，打得他们死伤惨重，只能是纷纷放弃工事撒腿逃命，辛苦修建的坚固工事也基本上形同报废。
还有清军针对渡口修建的炮台