军队还是有所顾忌的，对突然开着先进兵舰到来的黑旗军，怕引火烧身不敢轻易妄动，眼看着黑旗军灭了苏禄苏丹国。因为当时，荷兰殖民者对印尼群岛的控制实际已经很微弱。婆罗洲上的荷兰武装不超过两千人。
根据荷兰宪法的规定，印尼的最高统治权属于荷兰国王。为了压制印尼人对荷兰重新统治的不满，克服财政上的困难，荷兰殖民者在政治和经济方面，都采取了严厉的奴役措施。对当地封建苏丹和土王，荷兰进一步剥夺他们的实权，只保留徒有其名的称号，让他们领取固定的薪俸，成为殖民政府的工具。在经济方面，荷兰继续推行强迫供应制和实物地租，强制人民种植咖啡，恢复贸易垄断。对过去封建领主同英国商人签订的租借土地的契约，一律宣布无效。此外，殖民政府还实行了一系列名目繁多的苛捐杂税，如在道路、桥梁、河口、市场等处设立关卡，进行征税，甚至连怀抱的小孩过关卡，也要纳税，称为“屁股税”。直到1855年，由蒂博·尼哥罗领导的轰轰烈烈爪哇人民大起义才宣告结束，又重创了荷兰的殖民势力。
爪哇港口当中，两条陈旧的荷兰巡洋舰正在锚地，穿着殖民地热带水兵服的荷兰海军水手趴在栏杆上面，望着“龙腾”战舰上故意没盖炮衣的数十门崭