延残喘，艰难突破清军封锁，进入福建境内，与杨辅清会师。会师之后，两军兵力发展到近二十万，形势正待回转，变乱却在此时突生。
天王洪秀全恢复了杨秀清的爵位，召杨辅清为中军主将。
杨辅清在福建活动，为了扩大自己的影响，自命杨秀清继承者，宣布承袭杨秀清封号“东殿”。
石达开很不满，因为东殿比翼王要大，他怀疑杨辅清想取而代之。加之石达开在浙江惨败，杨辅清力量壮大，已有盖主之势，石达开部和杨辅清会师后，对杨辅清进行打压，引起杨辅清的不满。
后来，矛盾爆发，石达开欲加害杨辅清，夺他的军权。
不愿自相残杀的杨辅清察觉后连夜遁去，带军六七万人，一路丢弃在福建的太平军据点，脱离石达开，转战江西，回归天国。洪秀全册封五军主将，以杨辅清为中军主将，和陈玉成，李秀成同官职，杨辅清从此专心为洪秀全效力。
杨辅清走后，石达开军力不足十万，且皆浙江败亡部众，早成惊弓之鸟，重要据点又被杨辅清放弃，福建局势恶化，一夜回到解放前。事实证明，石达开缺乏成就大事的度量和气质，不太会拉拢将领，比洪秀全差远了，结果众叛亲离。
李元度及