后来仗着皇上的宠幸，连恭亲王也不放在眼里了。今日的肃顺，就像是康熙朝的权臣鳌拜。恭亲王以及在他身后的满蒙亲贵，在朝廷中势力也不小。鹿死谁手，还不一定。
曾国藩不愿意卷入宫廷权力的斗争中，派不派湘军北上勤王，这确实是一个艰难的决定。曾国藩思考良久，没有立即答应王闿运，让他暂住在祁门的军营里。
这时候的曾国藩和湘军，处境有点进退两难。因为当初咸丰皇帝的圣旨传到宿松，内容是：“曾国藩着先行赏加兵部尚书衔，迅速驰往江苏，署理两江总督。”
两江总督，是清朝最高级的封疆大臣之一，总管江苏（包含上海）、安徽和江西三省的军民政务，咸丰皇帝的圣旨却是要曾国藩带兵前往江苏，才让曾国藩署理也就是代理两江总督。
这道圣旨是“特急”，因为当时李秀成攻取了苏州等地。当时整个江苏的局面是严峻的：整个苏南，除上海一隅外，已全部落入太平军手里；苏北皖北，捻军势力大为增长，行踪飘忽不定，州县无法对付；在浙江，李秀成的部队绕过杭州，出没于浙西一带；江西饶州、广信、建昌、抚州等地，经常被李秀成的堂弟李世贤的人马任意往来。
曾国藩当时和曾纪泽、彭玉麟、杨载福