努尔哈赤非常器重刘兴祚，而且关系颇为亲密，主观上不相信刘兴祚会背叛他，所以并未发兵消灭他，只是将他由总兵降为参将，并予以警告，希望他不再如此行事。
但刘兴祚仍旧心系大明，宁远之战和广宁之战，刘兴祚“俱遣人先报”，使之“得以为备”，算是给大明当了一段时间的内应，这两次作战的成功，刘兴祚算是立了不小的功劳。
崇祯元年，刘兴祚终于下定决心，率领麾下将士反正归明，他镇守的旅顺也重新归大明掌控，大明算是在辽南重新获得了一个战略支撑点。
由于当初策反刘兴祚的登莱巡抚袁可立已经调任他处，他就被安置在蓟辽总督袁崇焕麾下，袁崇焕这厮也是恬不知耻，将刘兴祚反正的功劳加在自己头上，旅顺也就成了袁崇焕的地盘，后来发生的双岛斩帅，也就是袁崇焕矫诏斩杀东江总兵毛文龙，也是发生在旅顺西侧的双岛之上。
原本旅顺只是一个将来反攻建奴的桥头堡什么时候反攻只有天知道，但是登州失陷后，旅顺就承担起了东江镇粮饷通道的作用，如果此时旅顺再有闪失，崇祯相信，事情很可能就会变得和毕自严所说的一样严重。
但是崇祯还是坚持道“爱卿所说的这些，朕都明白，为防这