答道：“我得蒙圣上恩宠执掌东厂，为朝纲稳固诛除了多少叛逆？那些个在逃的人，哪个不想置我于死地？这就是他们的借刀杀人之计，幸亏圣上天纵英明，识破了歹人的奸计，不然老臣就要身首异处了。”魏忠贤这番话毒辣无比，他既拍了熹宗的马屁，又将自己美化为明室的忠臣，更暗指徐谦与歹人是一丘之貉。”
徐谦冷冷一笑，对魏忠贤说道：“魏贼，你刚才借用奸臣蔡京的典故，究意是什么居心？”魏忠贤答道：“圣上睿智，当然知道我的用意。这不过是个比喻，徐御史何必借题发挥，要将我除之而后快呢？”
徐谦如鲠在喉，此时他已经无力回天。熹宗命太监摘去他的冠帽朝服，交由刑部严加审问。许显纯沿用对付杨涟的办法，三木之下何愁不得口供？徐谦在狱中受尽折磨，却依然铁骨铮铮。几轮酷刑过后，许显纯已经失去了耐心，他恶狠狠地徐谦说道：“徐谦，识时务者为俊杰，都到了这步田地，你还摆什么书生的臭架子？趁早招认了，还免得皮肉受苦。”
徐谦冲他的脸上吐了唾沫，他大骂道：“为虎作伥的恶贼，我就是变成鬼，也会找你来算账。”许显纯气得怪眼乱转，他命令狱卒继续拷打徐谦，徐谦昏晕之后许显纯按住他的手指，在供状之上画了押。