独孤汉，杨侗随即下令大规模清除转轮教残余势力，他担心还有什么教派、势力怀着与独孤整一样的恶毒之志，隐藏在大隋中枢看不到的地方，准备在大军南征之时来上一记重创，思考再三，决定暂缓南征大计，动用内卫、黑冰台、修罗卫和军方力量，对大隋进行了一场大清洗。
冀州、幽州、并州、辽东、雍州、凉州的各地郡兵、军队，统一由杨恭仁和韦云起在洛阳指挥，顺藤摸瓜的查处商行、商队、关闭店铺，抓捕不法商人，很多被敌方势力和世家门阀买通的地方官员纷纷落网，短短一个月的时间内，从冀州到并州，从辽东到凉州，从河北到河北、河西，五百多家店铺被封闭，两百多名官员被抓捕，三千多名敌方间谍和被买通的人落网；至于渤海郡转轮教的佛爷、佛子、佛孙、佛徒和上千名骨干，也纷纷落网。
对于六千多名落网之徒，杨侗毫不手软，下令这些人及其家眷一律处死，这高达五万余颗人头令天下震惊，也狠狠地震撼大隋官场，让他们意识到军武起家圣武帝，心中那股铁血之风始终还在，一个个都夹起了尾巴当官办实事。
在这一次雷霆万钧的行动当中，没收黄金数万两、白银十多万两，钱财五十余万贯，各种奇珍多不胜数。
转轮教信众自愿献