偶然的机会，一名扮作跑堂伙计的锦衣卫，在打扫卫生时，发现这一楼下面竟然有一处地下室，而且地下室的面积，几乎是和一楼的面积是同样的。
负责百草堂的一位锦衣卫小旗统领立刻将此情况报告给总旗统领方柄。方柄赶过来查看后，大喜过望。
自从倭军占领王京后，锦衣卫指挥衙门已经不可能再正常运转下去。从衙门内转移出的各种重要物资、档案材料等，一直没有找到一处较安全的存放点。百草堂下发现的这处巨大的地下隐蔽空间，正好可以用来存放这些东西。
这样，在严格保密的情况下，百草堂下面的地下室，就成了城内锦衣卫最为秘密的一处重要物资存放点。
骆石印一行六人就被方柄秘密安排在百草堂。正常情况下，他们居住在二楼的房间内，如遇倭军搜捕，则快速躲进地下室内。
这段时间，骆石印已将入朝以来侦查到的，有关平壤、王京等重要地点倭军军力部署情况写成奏折，交给方柄，通过城内锦衣卫建立的秘密渠道，投送出去，正在以最快的速度送往北京。
方柄呈送给他的国内送来的书信，骆石印已看过，这书信竟然是神宗皇帝写给他的御笔书信，在信中，神宗皇帝告诉他，朝廷已经下诏任