个最大的缺点，那就是组阵人数太多，不可控性也就相应大增，封神之时，通天教主刚刚创出这万仙阵不久，很多地方还不太完善，对解教仙人们集合起来的力量做不到完美操控，加上截教不少弟子被阐教策反，在发动大阵的的时候倒戈相向，最终导致万仙阵被破，截教弟子几乎死伤殆尽。..
自封神之战后，通天教主便将碧游宫从金鳌岛搬到了上清天之中，万仙阵也成为了绝响，再也没有出现过，只有天庭之中真正有见识的人才知道，鸿钧道祖将通天教主所创的这万仙阵进行了改良，和封神榜、打神鞭一起传授给了玉帝昊天，玉帝可以凭借封神榜之中存留的神人神格来凝聚仙身，短时间内塑造出一万仙人来，发动万仙大阵。
当然了，单凭封神榜之中的神格来凝聚仙身对封神榜的消耗极大，玉帝也承受不住这样的消耗，所以大阵的关键部分需要有真正的仙神来组成，那些个神光便是玉帝用来控制一众仙神的，这些仙神已经被神光灌体，若是不遵照玉帝的命令组阵的话，玉帝随时可以引爆神光，到时候他们不死也会重伤。
可以说，鸿钧道祖改良之后的万仙阵已经消除了原本的万仙阵的隐患和缺陷，除了威力有所下降之外完全不存在因为组阵之人的背叛而导致阵法被破