们从根本性质、基地及势力范围来看，二者存在根本性的区别。
当然，我们首先承认二者之前确实存在很多相似之处。比如活动范围近似，二者都是世界性组织；再比如二者所处时代相同，都成立于资本主义原始积累阶段。
但二者的区别却是根本性的不同。英属东印度公司作为英国女王的特权组织，由伊丽莎白一世授予伦敦商人协会特权，专营印度贸易权后而成立股份制公司，是王权至高无上的体现。
历史上于十五年后英属东印度公司业务以殖民掠夺为主，特别是发展到后期，随着贸易的逐步扩大以及荷属东印度公司的逐步退出，实际上已经由单纯的商业组织转化为政治、军事、商业的暴*力集团。
而荷属东印度公司主要从事的是商业性活动，荷属东印度公司是世界上第一个股份制公司，以政府为第一大股东，向全体国民集资。
这个公司作为荷兰松散联邦制与英国强大王权争夺东方贸易权的利器，充分显示出了金融资本的力量。而这也是荷兰人更多的被称为海上马车夫，英国人却更多以殖民者、侵略者名义出现的根本原因。
而且二者主要海外基地及势力范围不同，荷兰东印度公司主要基地在南洋群岛，也就是现