十万减死一等」。另一种是按照汉景帝时期所颁布的法律「死罪欲腐者，许之」，处以腐刑（阉割）。
由於没有足够的金钱可以赎身，司马迁只得接受腐刑。对此他曾表示过「祸莫憯於欲利，悲莫痛於伤心，行莫丑於辱先，而詬莫大於宫刑。刑餘之人无所比数非一世也」。
出狱后，司马迁改任中书令，发愤撰写史书，亦欲「究天人之际，通古今之变，成一家之言」，完成了中国第一部纪传体通史─《史记》。
《史记》最初没有书名，司马迁将书稿给东方朔看，东方朔佩服不已，将其命名為《太史公书》，后世称《太史公书》為《史记》。
「史记」原本乃各国史书的通称，司马迁的著述也正是参考战国时期各国史记所作。但后来因为《太史公书》的影响，大约在东汉时期，就已经成为此书专名。
司马迁完成《史记》后，知道该书不被当世所容，故预先将正本存之名山，将副本置於京师，以期流传后世。
《史记》对后世史学和文学的发展都产生了深远影响。郑樵称：「六经之后，唯有此作」。
鲁迅称誉《史记》为「史家之绝唱，无韵之离骚」。
赵翼《廿二史札记》说：「司马迁参酌古今， 发凡起