对亚里斯多德有些不满，而亚里斯多德也终於发现柏拉图在重要学说上与他存在分歧，不过他始终对老师充满了敬意。
柏拉图去世后，由於学园的新首脑比较同情柏拉图哲学中的数学倾向，令亚里斯多德无法忍受，便离开雅典。
从亚里斯多德的著作中可以看到，虽然亚里斯多德不同意波西普斯等学园新首脑的观点，但依然与他们保持良好的关係。
据悉，离开学园后，亚里斯多德先是接受了先前的学友赫米阿斯的邀请访问小亚细亚。赫米阿斯当时是小亚细亚沿岸的密细亚的统治者。亚里斯多德在那裡还娶了赫米阿斯的侄女為妻。
但是在公元前344年，赫米阿斯在一次暴动中被谋杀，亚里斯多德不得不离开小亚细亚，和家人一起到了米提利尼。
3年后，亚里斯多德又被马其顿的国王腓力二世召唤回故乡，成為当时年仅13岁的亚歷山大大帝的老师。
根据古希腊著名传记作家普鲁塔克的记载，亚里斯多德对这位未来的世界领袖灌输了道德、政治以及哲学的教育。
亚里斯多德也运用了自己的影响力，对亚歷山大大帝的思想形成起了重要的作用。正是在亚里斯多德的影响下，亚歷山大大帝始终对科学事业十分关心，对