天的篇幅刊载美国连环漫画《大力水手》。
1968年1月,柏杨因《大力水手》翻译文中提及大力水手卜派父子流落至一个丰饶的小岛而乐不思蜀,两人要各自竞选总统,撰写竞选文宣,柏杨将「Fellows」(伙伴们)翻译为「全国军民同胞们..」,遭国民政府情治单位理解为对蒋中正父子的暗讽,以「共产党间谍」及「打击国家领导中心」的罪名逮捕,判处十二年有期徒刑,1969年起囚於台北县景美镇军法监狱。
不过根据台湾作家、时事评论家李敖的说法,《大力水手》是由一位女性侨生翻译,柏杨只是照抄才出事情。
1969年倪明华提出离婚要求,结束十年的婚姻,柏杨在狱中绝食二十一天。
1972年跟台北其他政治犯一同解送到国防部绿岛感训监狱。1975年,因蒋中正逝世,而减刑三分之一为八年有期徒刑。
1976年刑满后仍被留置於绿岛,后来因为国际特赦组织等人权团体的要求才被释放,共被囚禁九年又二十六天。
柏杨在狱中完成了《中国人史纲》、《中国帝王皇后亲王公主世系录》、《中国历史年表》三部书稿。原本还有第四部《中国历代官制》,因为参考书於1975年被官员搜去