祖巫殿剩余大巫以血祭的方式将此事告知囚禁在无涯山的祖巫共工。共工大怒，遂发洪水于天下，以警世人。
共工本意不过惩戒一番，聊以示威耳。
奈何其本身神通广大，散落人间各个幽暗角落的妖族又不断兴风作浪，普通巫师也趁机推波助澜，发泄心头怨气。竟使得这场洪水声势越发浩大，越演越烈，渐渐不可收拾。
道门三教本来见祖巫发怒，心下也确实有愧。起先便也听之任之，任由洪水泛滥。但见大水经久不息，百姓流离失所，苦不堪言，终于也忍不住了。
三教圣人同时发旨，命弟子下山相助人皇治理洪水，又遣相继警告共工，令其安分守己，莫要再造罪孽。
共工不过一时愤怒，听了圣人言语，自然收手。
然而洪水滔天之势已成，源头虽断，洪水一时却仍然无法消退。
一时间，三教各显神通，巫妖并逞手段，三界再次热闹起来。
人间洪水肆虐，三教圣人命门下齐出，救助人族于危难之中。
人教玄都**师化身赤松子四处传道，普施符水，教民简朴安乐之道。
阐教金仙在燃灯、云中子、南极仙翁的带领下径去求见人皇舜帝，声言要助人族斩妖除魔，