弥天的大火吞噬了一切，给冬木市的人民心中留下了难以磨灭的印记！
夜空被盛大的红莲之火渲染，地面无休止的上演着死亡的狂宴！
由于第四次圣杯战争并没将魔力使用掉，所以使得经过10年的积累冬木地脉又积累到了足以使圣杯降世的魔力，圣杯战争提前打响。
卫宫切嗣早已因为承受了被破坏的圣杯的巨大诅咒而缓慢而痛苦的死去。但是他收养的一个孤儿如今已经长大，成为一个渴望成为和养父一样坚定的贯彻自己的信念而活下去的少年。
爱因兹贝伦家族以“黄金圣女”为基准，制造了一个纯魔法回路组成的少女人偶型态的圣杯，这样战斗即使失败，却仍然能够在接下来的活动中将魔力连通的通道（圣杯）控制在己掌握之下；同时为了最大限度的争取最终的胜利，为其召唤来强大的berserker之英灵作为保护。这具银发的少女人偶被命名为——依莉雅苏菲尔?冯?爱因兹贝伦。
在十年前的第四次圣杯战争中，远坂一族阵亡的魔术师的女儿至今一刻也没有忘记过抱有“获得胜利”的执念，成为远坂一族中唯一继承了家族的姓氏的传人——远坂凛。
而第五次圣杯战争中最关键的人物——远坂凛的孪生妹妹，