幅有限的对于许多次要角色的描绘不足，挖坑没空填等等。而正传所有的事件事实上都发生在单短短几个月内，太过紧凑与秘籍于是就造成了故事结构的不合理。
简直就跟一年过好几次情人节圣诞节。一天需要去好几个杀人现场。满世界乱跑的死神小学生柯南一样。
不过柯南是单元剧。忽视这些也能看，而《魔法**目录》的剧情连贯性很高，因此就给人一种“乱”的感觉。
不过《魔法**目录》真正吸引人的地方，又不是它的文笔之类的，而是它那天马行空的设定以及恢弘的世界观。
整个《魔法**目录》故事发生舞台是近未来，表世界以现实世界为原型，科技并没有突破性进展，vr技术仍然处于小范围实验阶段。火星探测器在火星取回样本，超级计算机仍然使用硅晶体等，各国维持现实世界的基本格局，美帝最新型军机仍然是第五代战机的改进型，mirv仍然作为最后的核报复手段，民航，运输，世界经济和政局并没有因为学园都市和十字教而翻天覆地，基本上是中规中矩地向前发展。
一些为了剧情发展而做出更改，比如《魔法**目录》中英国是无核国家且是君主制。梵蒂冈拥有军队而不是瑞士近卫队，十字教（原型是现实中一