重两个指挥直属统制管辖。
步军所辖二十个指挥，计有官兵一万零三百二十人，暂时皆不满编。所部军官除各军各部升任或提拔的外，绝大多数军官皆来自原殿前军，他们的所有人除一队编入王府亲兵队外，大多官升一级，或两级。
之所以如此也是无奈之举，原护军训练时间尚短，本来就缺少合格的基层军官，根本不堪调用。而义勇各部更是如此，他们作战勇敢，但缺乏训练，军官只是由有声望或是武艺高者担任，指挥作战全凭感觉。可殿前军经江氏父子严加整训，整体素质较高，原本想将他们作为精锐力量统一使用，但基于当前严峻的形势也只能拆散使用。
水军统制由副都统制刘洙升任，由于此次又接受大小船只二百余艘，仅操舟的水手就不是个小数目，操蛋的是船上原有的水手几乎都被带走，只留下空船。所以尽管当初原水军已经按照双倍人员配属，可也远远不够用，他们急需补充兵员。除将疍兵补入外，又让他们从义勇中优先挑选了一批擅水者补入，兵力也随之膨胀为五个指挥和十二个队，近五千人。但由于船有大小，各个指挥和队人数不尽相同。
按照原来定下选兵的规矩，指挥以下军官皆由所属主管选定，逐级选拔后报备到制司，而兵丁