数个部省，调动和补入的官员上百，但赵昺依然不敢大意，从事务局抽调人手会同御前办对举荐和拟任命的人员进行复审，标准就是家事清白，政治过硬，业务精熟，文官有在军中任职的经历，武人有领兵作战的经验。
如此一来工作量大增，不仅御前办的人夜以继夜的工作，赵昺当然也闲不下，淡泊阁的烛光常常彻夜不熄。而白日他除了参加例行的朝会外，还要召开堂议协调各个部门的工作，诏令众臣进宫觐见询问情况。加上因为此次军改涉及编制的改动，不免引起人心浮动，他除了召集各部军将进行解释和安抚，还亲自前往各军巡视，以稳定军心，可谓是工作夜以继日，难得休息片刻……
八月末各部终于在赵昺严厉敦促下完成调整，兵部和枢密院在经过短暂的内部整顿后，于九月中旬开始正常办公，随即对各军的整编工作全面展开，而这项任务更加繁琐和复杂。而此刻陈吊眼再次率军攻下漳州，蒙元调集大军进行清剿，一时间东南震动。
如此陈吊眼称王自立的事情也为行朝所知再掀波澜，朝中众臣纷纷上书，或要求对叛逆予以剿灭，或请求对此部义勇予以招安。赵昺发现朝中众臣对待此事的态度有些微妙。
主张对陈吊眼这帮‘逆贼’予以剿灭的