从名义上讲出镇宗王为镇戍区最高军政长官，但地区行政并不归其管领，行政由行省地方官员掌握。二者的分工在于，出镇宗王重在统军镇戍，而地方行政及部分治安由元朝地方官僚系统控制，正是所谓“镇之以亲王，使重臣治其事”。由此形成戍地、宗派不同的出镇体系。
江南元军经过两次征讨琼州，讨伐安南、占城及远征日本几乎皆是由江南新附军抽调，这些战事使得新附军兵力大损，尤其是征日本就有十五万人殒命大海。而这也可以说是忽必烈有意为之，要知道探马赤军人的军需装备，主要由军户自备，不足部分由政府补给。汉军士兵的冬、夏军装和武器，由政府发给，并按月发放口粮，服装的不足部分、其他装备和开支，由本军户和贴户凑齐，定期送到军中。
军户制的实行，可以保证国家有稳定的兵源，又可以维持一支庞大的军队而使政府负担不致过重。而新附军人的装备，全由政府供给，口粮每月米六斗、盐一斤，家属每月每人支粮四斗，可以说供给全是由国家财政支付，庞大的数目对于哪个国家都是沉重的负担，忽必烈便将他们当做了消耗品。多年后屯驻江南的新附军数量大为减少。
随着对外战事的减少，忽必烈觉得江南业已稳定，便在至元二十二年