淮西方面同样面临兵力不足的问题。还有随着战场的延伸和地方官员的进驻管理，也存在着名不正言不顺的问题，需要进行调整捋顺各方的关系。
现在江东战事结束，这些问题都需要解决。赵昺考虑再三，随即命倪亮统领御前护军第一旅、第二旅、第三旅、第五旅和骑兵旅、炮兵旅，移兵平江休整三日，就近补充兵员缺额及辎重粮草，搭乘御前水军的舰船北上盱眙，准备迎战蒙元的侍卫亲军。第四旅则返回临安，警备京师安全。
政务繁杂，赵昺此次索性令下旨命参知政事王应麟兼任淮南东路安抚使，总领淮东政务，授予其组建州军、任免官员之权，尽快完成对淮东新收之地政权建设，尽快展开人口和田地的普查登记，并收拢流民、安抚百姓等工作。而他则专心谋划接下来的战事。
又下旨撤销江东制置司，免去赵孟锦江东制置使的职务，改任淮东行军总管，原置司臣僚及直属队转隶总管府。参知政事江璆兼任江东安抚使总领江东政务，并调原常州知州蔡若水为江东转运使兼平江知府，待赵孟锦交接完毕后，即刻领禁军第五军及配属的炮兵第一师和骑兵第一师搭乘第一水师的舰船北上山阳。
撤销湖广制置司，免去江钲制置使之职，改任淮西行军总管，