维持国家的运转，更没有办法通过赈济灾荒、兴修水利、减免赋税来收买人心，这对士人为主体的官僚系统冲击力不小。而有钱的赵昺却能通过赏赐的方式做到，且通过向朝廷借贷来达到自己的政治目的。
不过这套在琼州行之有效的方法，待赵昺进入中原后却不大灵光了，给了自己一个狠狠的下马威，他们因为对自己‘滥杀’士人深表不满，联络朝中一些权臣发难联名上书质疑自己正统的身份，要将他赶下台去。使得自己不得不暂且退居幕后，由太后监国，很是吃了瘪。
赵昺在退居观中也曾想过为何会出现如此问题，以为琼州毕竟是个弹丸之地，自己可以轻易的了解局势的变化，从而及时处置。且在国难当头之时，仍然能够追随行朝的人多数还是心怀忠义，以忠君为国为己任的。而江南沦陷后，诸多的士人或者当了带路党，或是被征辟仕元，或者退隐乡野，人员构成复杂。
而收复江南后，赵昺下旨镇压了诸多叛国者从而引发恐慌，担心被牵扯其中，又因为没有重新获得启用，有被抛弃之嫌，于是引发了动荡。但是在杨太后的支持及众臣的力保，自己动用军队平息了这场变乱。但也使得赵昺明白江南士人潜在势力的强大，迫使自己不得不在某些事情上做出妥协，以免