延伸到北直隶，朝廷为了让剿灭流寇的事权同意，决定设立五省总督，代表皇上和朝廷统一负责剿灭流寇的事宜。
最初的五省总督人选，是三边总督、延绥巡抚洪承畴，但是洪承畴的任务很重，延绥一带时常有后金鞑子骚扰，无法抽身，所以皇上和朝廷决定让陈奇瑜出任五省总督，于是陈奇瑜被擢升为兵部右侍郎，兼任五省总督。
陈奇瑜其实有机会流芳千古，至少能够彻底剿灭流寇，让大明王朝多维持一段时间。
车厢峡之战，陈奇瑜率领的大军，已经围困了流寇的主要首领，高迎祥、李自成、张献忠和马守应等人，悉数被围困在车厢峡，特别是李自成和张献忠等人，他们正是推翻大明王朝的农民起义军领袖。
如果陈奇瑜稍微清醒一些，坚持剿灭被围困在车厢峡的流寇，历史的走向或许会发生改变，而陈奇瑜也可能成为大明王朝的中流砥柱。
陈奇瑜在车厢峡之战判断失误之后，做了一些让人不齿的事情，他拼命的推卸责任，导致宝鸡知县李嘉彦和陕西巡抚连国事等人被诬陷入狱，后来兵科给事中顾国宝弹劾陈奇瑜，将车厢峡之战的真正内幕揭露出来，陈奇瑜因此被皇上降罪，发配到边疆充军去了。
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