宁军二十万驻在京畿，压得不能喘气，这回倒好，堂而皇之又调了二十万进来，显然要替换安东都护及两江等地的卫所兵。但是对于这道诏令，却无反对之声，倒是有人建议增补左右仆射之缺，以免尚书省政务停摆。
皇太子略一思索，户部尚书王易芳倒也称职，只是并不向着西军，何况征调粮食之事也未能执行到位，遂以此为由将他稍稍降级，贬谪为浙江布政使，擢拔容承圻为户部尚书。令他清查黄册库，重新勘察全国土地，以三月为期，报出地籍数字。在此之前有退回强占民田或自己呈报虚挂在有功名的士人底下逃税的，一概不予追究。
攻打京城的二十万军队被军知院分走了五千人，留下十六万负责京城防卫，剩下三万五，派给了中军一个牙将五千。到铜陵去负责督收矿权，另外三万分做三队，号称“平寇番”，由前军两名副将，右军一名副将率领，分赴湖广、浙江福建、川西云贵三地剿灭匪患。
陆蒙恩做了尚书左仆射，刘通做了右仆射，瞿道广一看永绍帝大势已去，请求告老还乡，太子和颜悦色地准了。命吏部将各年官员考绩档案送往东宫。
中书省论资排辈，理该次辅唐国公张晟上位，但皇太子只命他暂理中书事，却并没有直接任命。