天启面前进谗言，说孙承宗想以清君侧之名诛杀他，又亲自跑到天启面前哭诉。
天启信以为真，连忙派快马阻止孙承宗回京，孙承宗刚抵达通州便收到了天启的旨意，只得无奈退回辽东。
魏忠贤这次着实被孙承宗给吓坏了，因为孙承宗是帝师，他原本不想跟孙承宗起冲突，但是，这次他却不得不出手收拾孙承宗了。
于是乎，朝中阉党官员不断上奏弹劾孙承宗盲目扩军只为冒领军饷，孙承宗无奈，只得罢免总兵尤世禄和李秉诚等将领，并裁撤军队一万七千余人。
但是，魏忠贤目的并不是让孙承宗裁军，而是想将孙承宗拉下马，就算孙承宗裁军缩减军饷，他还是不断的命自己的党羽找机会弹劾孙承宗。
天启五年九月，山海关总兵马世龙误信降将刘伯漒，派人袭取耀州，结果中了建奴的奸计，损失四百余人，魏忠贤党羽趁此机会，大肆弹劾马世龙和孙承宗，孙承宗被迫辞呈，魏忠贤派出党羽高第接任蓟辽督师。
高第上任后立刻下令，命关宁锦防线所有军民全部撤回山海关内，将辽东刚刚收复的四百余里河山拱手让给建奴！
这几年，因为孙承宗修筑的关宁锦防线太过牢固，让建奴无从下手，努尔哈赤不