华夏新朝的政治制度，在曹孟德一统天下之后，便已经在着手革新。只不过此前因不曾开国，一直沿用前汉规制。此时既已开国，便则要全然替换才是。
曹孟德因与赵昱相交，太和别院当中的许多藏书，尤其是赵昱从现代时空带来的一些书籍，早被曹孟德翻烂。
因此华夏新朝的制度，在保证君权集中的前提下，汲纳了不少现代时空书籍当中的精华。
去三公，而设左中右三衙，左衙主立法，中衙主司法，右衙主行政。三衙之首为左中右三位丞相。而此时以右为尊，由是右衙乃三衙之首。而军权独立于三衙之外，设兵主衙。
以荀彧为右丞相，掌右衙，主宰天下行政。以田丰为中丞相，掌中衙，主司法刑事。以程昱为左丞相，掌左衙，主立法之事。
这三衙，以右衙为主，右衙下设九部，九部之首为九卿。分责教育、经济、农业、户籍、税务、工业、商业等九大权责。
中衙下设两部，一部主缉拿巡捕，一部主审判定刑。
左衙同设两部，一部为天下巡查，一部为律法整修。
而兵主衙门，则为天子亲掌，下分四部，一部为参赞谋划，一部为物资后勤，一部为调兵遣将，一部为战功