不但是工部部臣，亦是元炁殿元器堂次座，仅次于首座李真人。
虽然《天工开物》是‘科学’著作，但于元器一道，亦有奠基之效。元器虽以元符为根本，但在整体结构构造等方面，仍然有外道需求。
宋应星入朝之后，主持工部方方面面的事务，接触到元器之后，对此产生了巨大的兴趣，向嬴翌上书请入元炁殿，嬴翌许之。
他进入元炁殿之后，首先就针对之前的乾丙型战车、坎丙型船只的结构构造提出建议，使得这两种元器得以优化，结构更加合理。同时在工程元器的实践中，也起到举足轻重的作用，因此成为元炁殿元器堂的次座。
实际上作为一个研究型的人才，宋应星更多的精力还是放在了元炁殿。工部的诸多事务，除了需要他点头盖印的，大部分还是由工部副臣方以智和揭暄主持。
宋应星入朝时身背佝偻，颤颤巍巍。如今虽须发斑白，但面如稚子，精力充沛。他在陛阶之下侃侃而言，声音洪亮，胸有成竹毫不停顿。
“...经过数月努力，工部与商部已经完成了帝国道路交通体系计划的全部前置事宜。”宋应星道：“分段承建方面之事，稍后由商部刘一黔部臣向陛下详细汇报，微臣这里就说说具体建设方面