二十年时间里，他除了继续负责清华建筑系的工作之外，还主持开展京津冀城乡空间发展规划研究，对2004年北京城市总体规划修编、天津总体规划修编等重大项目发挥了极其重要的作用。
编写出版了《建筑·城市·人居环境》、《京津冀地区城乡空间发展规划研究》、《北京宪章——建筑学的未来》、《学术文化随笔》、《人居环境科学导论》、《世纪之交的凝思：建筑学的未来》、《发达地区城市化进程中建筑环境的保护与发展》、《城市与区域规划研究》、《明日之人居》等一系列重要学术专著。
在他七十岁之后，依旧不断产出各种高质量的科研实践成果，这要是没有旺盛的精力和强健的身体可是万万做不到的！这样的人说自己连两个小时的演讲都应付不了，林楼怎么可能相信？至于外语的问题，吴委员可是在美国留过学的，口语水平相当高。
是啊，我知道我的身体条件还不错，但毕竟已经是七十多岁的人了，未来还能工作多少年谁也不敢保证，所以才要在我尚有余力的时候，把你扶上马送一程，等你能从我手里接过清华建筑系和中国建筑界的班，我也就彻底安心了。
一想到这些，吴委员就倍感庆幸，和科学院里其它学部委员相比，自己绝对是