舂陵军成功攻占新野，刘秀一部阻击郡军渡江的任务也算是圆满完成，随即率军从淯阳东岸撤退回新野。刘
秀一部比刘縯一部晚到新野三天，在这三天的时间里，舂陵军可没闲着，于新野城内展开了一场血腥的杀戮。
舂陵军中很多人的家都在新野，像邓禹、邓晨、邓奉等等，他们的家眷、亲戚，当初有跟着他们一同去到舂陵的，那还算好，总算捡回了一条命，而这些没跟他们走，继续留在新野的，全都遭了殃。
新野县衙将这些人一律以参与谋反论处，全部处以了焚刑（烧死）。这些无辜遇害的人，前前后后加到一起，不下千人。
可以说新野县衙对舂陵军的家眷亲属是下了死手。现在舂陵军攻占了新野，能不找这些人清算，能不大肆报复吗？县
衙官员，由上到下，几乎无一例外，全部被处死，其家眷也未能幸免，男子斩首，女子被贬为官妓。
另外，舂陵军又在城内张贴出悬赏令，鼓励新野百姓举报当初的告密者，只要有人举报，调查就是走个过场，凡被具备者基本全被处死了。
仅仅三天的时间，舂陵军就在新野城内清算了三千余众。其中固然有罪有应得者，但很大一部分人还是被冤枉的