十五年，嘉靖皇帝将合祀改为分祭，修建九庙分别供奉明太祖朱元璋、明成祖朱棣，一直到明武宗朱厚照等九位先帝，祭典先祖的仪式通常要持续两、三个时辰。好在嘉靖二十年，太庙发生火灾，九庙中八庙被焚，不得已又恢复了合祀制度，不到一个时辰就能把九位皇帝都照顾到。在这一个时辰里，要上九次香，叩九次头，累是累一点，但所有行止都有礼官唱导，只要机械地照做就是，不必担心出什么纰漏。
祭完太庙，乘礼舆出太庙街正门，经天安门御道西侧的阙右门，至与太庙并称“左祖右社”的社稷坛，经东北门至正门外，下辇坐轿入右门，顺戟门东行至拜殿东阶下轿，在乐舞声中步行上坛行祀。
正方形的社稷坛分上下两层，各高尺，下层丈尺见方，上层丈见方，四面均有陛阶，各分级。坛顶积土为坛面，正中有一圆，周围分区，区分铺天下各州县送来的五色土：东青土、南红土、西白土、北黑土、中黄土，象征金木水火土五行，为万物之本，含“普天之下，莫非王土”之意；中央立有石柱，是名“社主石”，又名“江山石”，示意江山永固。坛上朝北设有两座神位，太社在右，太稷在左，皇上每年亲祀太社、太稷两位神祗，以表“非土不立，非谷不食，王者以土为重，为天下