可是，阴差阳错，戚继光在渡江战役中身负重伤，被留在江防军驻地镇江休养；俞大猷又回任营团军指挥使，统率营团军追击江南叛军余孽，其后还率军剿平了为祸广东的山贼，忙得不亦乐乎。朱厚熜就本着“充分利用”的原则，命戚继光在养伤之余，留心向江防军诸将请教水战之法，随后就将他委任为新组建的东海舰队提督；而俞大猷自然就因为“工作需要”仍留在了营团军。
尽管不知道俞大猷心中这些小九九，但朱厚熜也明白他定是求战心切，便信誓旦旦地表示，日后无论哪里有战事，第一个便调营团军上前线，并嘱咐他加紧练兵，以备国家之难。高拱和杨博两任监军也从旁劝说，这才安抚住了俞大猷。
平叛之役，俞大猷率江南游击军先行南下，汪宗瀚没有见过他，但渡江战役是汪宗瀚率船队将营团军送过长江，营团军战力之强悍令汪宗瀚为之惊叹更为之折服。因此，听戚继光说皇上已经驳回了俞大猷的抗议，答应将营团军前军划拨东海舰队之后，他便轻松了下来，不但再也不高声嚷嚷，还故做好人对戚继光笑道：“话又说回来了，象老曹带的那样的劲旅，哪个军门大帅不想留在帐下听用？我们这么做，等于生生剜去了俞军门的心头肉。他没有跟你动刀子，已是顾及往日的袍泽